开展一项有影响力的临床研究，最基本的一个要求是提出一个合理的、有临床意义的研究问题。研究问题的提出应该让研究者看到一条清晰的研究路径，并产生对患者和医生有意义的证据。
如今，大型数据库的激增，加上统计软件的便捷使用，使得任何人都可以“四处查看”数据。如果没有一个明确的研究问题，研究往往是毫无意义的，还有可能会导致不明确或误导性的结果。
《Neurosurgery》上发布了一篇针对“WritingaClinicalResearchQuestion”的综述，强调精心设计一个研究问题的重要性，并为撰写研究问题提供了建议。
基本概念
撰写一个清晰的主要研究问题，需要一系列步骤来定义所有必要的细节（图）。第一步是明确该领域的知识空白区。这需要对该主题和相关文献有深入的了解。一个好的研究问题应该解决当前领域一个重要的空白，如果这个空白被填补了，患者的病情可以得到改善。麦克马斯特大学的Haynes博士认为，在提出一个合理的研究问题时，明确已知和未知知识至关重要。
通过对文献的系统回顾、对重点人群和患者的访谈、以及对同领域专家的咨询，可以更彻底地评估该领域的研究现状。一些资助机构鼓励申请人在申请临床研究资助前，进行系统的文献回顾和小规模的试验性研究，以确保研究问题的准确性。
理想情况下，一个研究计划应该提出一个主要研究问题，这个问题应该包括研究对象、干预措施、研究结局以及统计分析计划，并且将其记录下来。这样在研究结束时，就可以通过“是或否”这种简单地陈述来作结论。
这个主要研究问题为研究者设定了正确的研究方向，通常决定了研究的样本量、可行性和预算。此外，这个主要研究问题通常在科研经费审批和发表过程中会受到审查。
还可以设计一些“次要”研究问题，但绝不应对主要问题产生影响。次要问题可以做亚组分析，或者评估不太重要的结局。次要研究问题的目的是确定对主要研究结果的潜在解释，并产生新的研究问题，但通常在这个研究中不会给出明确的答案。研究应有足够的把握度来回答一个主要研究问题。
提出明确的、可回答的研究问题是临床研究的早期关键步骤。使用统计软件在大型数据库中进行挖掘，如果没有预先确定的问题或假设，期望找到某些“重要的”东西，只会让事情变得“模糊不清”，不会为现有文献提供有意义的内容。一个单纯、简单的主要研究问题，结合大量可用的数据，是非常重要的。
研究问题一旦起草后，应与合作者、同事讨论，如果可能的话，还可以包括患者代表，以评估研究问题的清晰性、可理解度、重要性和可回答性。确定一个问题的可回答性，对临床医生来说可能是困难的。因为医生往往一次想回答的问题太多，这个时候能够把话题缩小到足以回答一个清晰的问题就很重要。
当然，临床上有很多有临床意义的问题需要解决。如果可能的话，应该选择影响最大且最重要的问题，不过也有可能需要一些初步的研究问题来证明或帮助提炼主要问题。
做临床研究，研究问题往往来源于临床实践中存在欠缺的地方。最重要的是，问出一个有意义的研究问题，制定和执行这个研究，然后将研究结果回到临床实践中验证，这是要提出研究问题的首要原因。
一个精心设计的研究问题可以提供显著的价值，但是一个计划不周的研究问题可能会严重影响研究设计，并在分析数据时造成显著的局限性，削弱了该研究解释问题清晰性的能力，所以应花充分的时间来拟订研究问题。这个经常被大家忽视，但在这个阶段进行合适的思考、资源和调查是至关重要的，花一个小时和统计学家或临床流行病学家讨论一个有重要意义的研究问题，是非常值得的。
制定研究问题的标准
Hulley及同事们制定了FINER标准，这个标准为提出好的研究问题提供了参考标准（表1）。包括研究可行性（feasible），激起研究者兴趣的话题（interesting），创新性（novel），符合伦理标准（ethically），与科研领域、临床策略的相关性（relevant）。
FINER标准是帮助研究人员选题的一个起点，创新性至关重要。当然，对于不是那么创新、旨在重现其他研究结果的研究，也是有一定作用的。
另一种是PICOT方法，它可能更有助于定义研究问题的具体组成部分。PICOT：研究对象（population）、治疗干预方式（intervention）、对照组（